VAERSA col·labora amb la Conselleria d'Agricultura, Aigua, Ramaderia i Pesca en l'execució del Programa Coordinat de lluita, control i erradicació de malalties dels remugants en la Comunitat Valenciana. 

Les malalties objecte d'actuació, són entre altres, zoonosi com la Tuberculosi bovina i caprina i la brucel·losi en el ramat boví, oví i caprí, amb l'objectiu, de garantir la sanitat de la cabanya ramadera de la Comunitat Valenciana. VAERSA també du a terme els controls serològics i de vigilància entomològica emmarcada dins del Programa Nacional de Llengua Blava en les explotacions ramaderes sentinelles de la Comunitat Valenciana.

VAERSA, des del 29 de maig de 2020 es troba acreditada en la norma ISO 17020 com a Entitat d'Inspecció de Sanejament Ramader per a les probes diagnòstiques de la IDTB (Intradermotuberculinització), presa de mostres de sang i sobre les inspeccions ramaderes de identificació i registre en les espècies bovina, ovina, caprina i equina.

Actualment, l'equip de veterinaris de VAERSA es troba distribuït per totes les comarques ramaderes de la geografia valenciana segons les necessitats de cada oficina comarcal agrària, comptant entre ells amb veterinaris de camp i especialistes en les aplicacions informàtiques de sanitat i producció animal de la Consellería d´Agricultura, Aigua, Ramaderia i Pesca.